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单细胞测序
 
  单细胞测序技术(single cell sequencing)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术,它能够弥补传统高通量测序的局限性,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。2013年,单细胞测序技术被《Science》将其列为年度最值得关注的六大领域榜首;2015年再次登上Science转化医学封面。目前,单细胞测序技术在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学、以及植物学等领域发挥重要作用。 正成为生命科学研究的焦点。具有广阔的应用前景。

  单细胞测序 传统高通量测序
定义 对于一个细胞群中的每一个细胞进行测序分析 对于一个细胞群体的所有细胞进行整体测序分析
检测量 包含100-10000个不同细胞的基因表达 仅包含一个整体细胞群体的基因表达
应用领域 当前主要应用于生殖,肿瘤,胚胎发育,神经发育,疾病,免疫研究等 各类常规研究领域
优势 1.准确地分析每一个细胞的基因表达 1.价格低廉
2.能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较 2.分析便捷,分析流程成熟
3.能找到西游的细胞的表达情况  
4.能对于微环境中的细胞间关系进行分析解读  
5.从表达量,细胞量,细胞组成等多种角度对于样本进行描述  


单细胞测序应用领域
肿瘤微环境研究 肿瘤的发生、生长及转移与肿瘤细胞所处的内外环境有着密切关系,单细胞测序解释了之前通过Bulk RNA-Seq无法准确进行的肿瘤细胞与周围微环境细胞间相互分泌与信号通讯的过程,无论是头颈部肿瘤,乳腺癌,神经胶质瘤均已开始有大量的测序研究阐述该领域。
肿瘤异质性研究 肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变,从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。它是恶性肿瘤的特征之一。单细胞测序由于能同时测定100-10000个以上的肿瘤细胞,使得我们从肿瘤细胞的具有异质性的Clonal角度进行研究成为可能,未来可能应用于临床治疗和诊断,真正加速精准医疗时代。
发育学研究 神经等组织发育、器官发生等领域的研究中,由于受到细胞微环境的影响,不同个体的细胞的发育命运是各不相同,因此单细胞测序有助于我们对于发育学研究的每一个细胞个体的基因表达和作用以及细胞间的通讯与影响进行解析。
免疫学以及其相关疾病研究 免疫学研究中,免疫细胞为了行使不同功能而具有极强的杂合性,在一组白细胞或者PBMC样本中,往往存在大量不同类型的免疫细胞。而单细胞测序,能在测定每一类细胞的基因表达的同时,对于这些细胞进行区分,甚至进行更准确的亚型分类,为免疫学研究和相关疾病的治疗提供帮助

样本准备

1)细胞类型:生殖细胞、胚胎细胞、神经细胞、免疫细胞、肿瘤细胞、干细胞、其他原代细胞;

2)细胞状态:细胞直径<40 μm;细胞活性>90%;细胞浓度5×105~1.2×106/ml;不含Ca2+和Mg2+

3)细胞数目:上门提取:≥ 1×105 cells/sample;

4)保存运输:为了减少运输过程及反复冻融对细胞造成的损伤,晶能提供上门服务!

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